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不同類型的電泳實(shí)驗(yàn)在凝膠制備和氣泡處理上有哪些特殊要求?

來(lái)源:上海易匯生物科技有限公司   2025年05月13日 14:43  

不同類型的電泳實(shí)驗(yàn)在凝膠制備和氣泡處理上有哪些特殊要求?

不同類型的電泳實(shí)驗(yàn),如 SDS - PAGE 電泳(十二烷基硫酸鈉 - 聚丙烯酰胺凝膠電泳)、瓊脂糖凝膠電泳、等電聚焦電泳等,在凝膠制備和氣泡處理上有各自的特殊要求,具體如下:

SDS - PAGE 電泳

  • 凝膠制備特殊要求

    • 凝膠濃度選擇:根據(jù)目標(biāo)蛋白質(zhì)的分子量大小選擇合適的凝膠濃度。一般來(lái)說(shuō),分離小分子蛋白質(zhì)(<20 20="" 60="" -="">60 kDa)則使用 7% - 8% 的凝膠。

    • 嚴(yán)格控制試劑比例:丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺的比例、緩沖液的 pH 值以及引發(fā)劑和加速劑的用量等都要精確控制,以保證凝膠的聚合效果和孔徑大小均勻性。例如,通常使用的分離膠緩沖液 pH 為 8.8,濃縮膠緩沖液 pH 為 6.8,過(guò)硫酸銨和四甲基乙二胺(TEMED)的用量要根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行優(yōu)化,一般過(guò)硫酸銨的濃度在 0.1% - 0.5%,TEMED 的濃度在 0.05% - 0.1%。

  • 氣泡處理特殊要求:由于 SDS - PAGE 電泳對(duì)條帶的分辨率要求較高,凝膠中的氣泡會(huì)嚴(yán)重影響蛋白質(zhì)的遷移和分離效果,因此在氣泡處理上要更加嚴(yán)格。在凝膠灌注過(guò)程中,可采用長(zhǎng)針頭注射器將凝膠溶液緩慢注入電泳槽中,盡量避免溶液與空氣接觸產(chǎn)生氣泡。如果發(fā)現(xiàn)凝膠中有氣泡,應(yīng)及時(shí)用細(xì)針挑破或采用振動(dòng)法使氣泡排出,確保凝膠中無(wú)氣泡存在,以獲得清晰、整齊的蛋白質(zhì)條帶。

瓊脂糖凝膠電泳

  • 凝膠制備特殊要求

    • 瓊脂糖純度和濃度:根據(jù)分離的核酸片段大小選擇合適的瓊脂糖濃度。一般來(lái)說(shuō),分離小于 0.5 kb 的 DNA 片段,可使用 2.0% - 3.0% 的瓊脂糖凝膠;分離 0.5 - 2 kb 的 DNA 片段,常用 1.0% - 1.5% 的凝膠;而對(duì)于大于 2 kb 的 DNA 片段,則使用 0.7% - 1.0% 的瓊脂糖凝膠。同時(shí),要選擇高純度的瓊脂糖,以減少雜質(zhì)對(duì)核酸遷移的影響。

    • 加熱溶解均勻:在制備瓊脂糖凝膠時(shí),需要將瓊脂糖粉末加入到緩沖液中加熱溶解。加熱過(guò)程中要不斷攪拌,確保瓊脂糖溶解,避免出現(xiàn)局部濃度過(guò)高或過(guò)低的情況。溶解后的瓊脂糖溶液要冷卻至適當(dāng)溫度(一般為 50 - 60℃)后再倒入模具中,防止溫度過(guò)高導(dǎo)致凝膠收縮或產(chǎn)生氣泡。

  • 氣泡處理特殊要求:瓊脂糖凝膠電泳中氣泡的存在可能會(huì)導(dǎo)致核酸條帶變形或出現(xiàn)斷裂現(xiàn)象。在倒入瓊脂糖溶液時(shí),動(dòng)作要平穩(wěn),避免產(chǎn)生氣泡。如果有氣泡產(chǎn)生,可以用吸管將其吸出,或者待凝膠凝固后,用刀片將含有氣泡的部分切除。對(duì)于一些低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠,由于其凝固點(diǎn)較低,在處理氣泡時(shí)要注意保持環(huán)境溫度穩(wěn)定,避免凝膠在處理過(guò)程中融化。

等電聚焦電泳

  • 凝膠制備特殊要求

    • 兩性電解質(zhì)選擇:等電聚焦電泳需要使用兩性電解質(zhì)來(lái)形成 pH 梯度。不同的樣品需要選擇合適的兩性電解質(zhì)混合物,其 pH 范圍要涵蓋目標(biāo)蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。例如,對(duì)于等電點(diǎn)在 4 - 6 之間的蛋白質(zhì),可選擇 pH 3 - 10 的兩性電解質(zhì),并適當(dāng)調(diào)整其比例,以獲得更精確的 pH 梯度。

    • 凝膠聚合條件精確控制:凝膠的聚合過(guò)程要嚴(yán)格控制溫度、時(shí)間和引發(fā)劑的用量,以確保凝膠中 pH 梯度的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性。一般在低溫(4 - 10℃)下進(jìn)行聚合,聚合時(shí)間相對(duì)較長(zhǎng),可能需要數(shù)小時(shí)甚至過(guò)夜。引發(fā)劑的用量要根據(jù)具體的凝膠配方和實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行優(yōu)化,以保證凝膠聚合均勻,pH 梯度穩(wěn)定。

  • 氣泡處理特殊要求:等電聚焦電泳中氣泡的存在會(huì)干擾 pH 梯度的形成,影響蛋白質(zhì)的聚焦效果。在凝膠制備過(guò)程中,要盡量避免氣泡的產(chǎn)生。如果出現(xiàn)氣泡,應(yīng)采用溫和的方法去除,如使用細(xì)針小心地將氣泡挑出,或者在凝膠表面覆蓋一層液體石蠟,防止空氣進(jìn)入凝膠產(chǎn)生氣泡。同時(shí),在電泳過(guò)程中,也要注意觀察凝膠中是否有新的氣泡產(chǎn)生,如有需要及時(shí)處理。



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