時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)
時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)（Spatially Resolved Transcriptomics, SRT）是近年來發(fā)展迅速的一個(gè)研究領(lǐng)域，它結(jié)合高分辨率的空間位置信息和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，以解析組織或細(xì)胞中基因表達(dá)的空間分布和時(shí)間變化。
時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)作為一項(xiàng)前沿技術(shù)，在發(fā)育生物學(xué)、腫瘤研究、神經(jīng)科學(xué)、免疫學(xué)研究、再生醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、疾病模型構(gòu)建等多個(gè)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域展現(xiàn)出廣泛的應(yīng)用潛力。
深圳華大生命科學(xué)研究院（以下簡稱華大研究院）作為時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)領(lǐng)域的主要推動(dòng)者之一，在2022年聯(lián)合多名科學(xué)家在《Cell》上發(fā)表了題為《Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball patterned arrays》的研究論文，結(jié)合 DNA 納米球 (DNB) 模式陣列和原位 RNA 捕獲來創(chuàng)建空間增強(qiáng)分辨率組學(xué)測(cè)序 (Stereo-seq)。應(yīng)用Stereo-seq生成小鼠器官發(fā)生時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜(MOSTA)，以單細(xì)胞分辨率和高靈敏度繪制了小鼠器官發(fā)生過程中轉(zhuǎn)錄變異的動(dòng)力學(xué)和方向性。這一創(chuàng)新性的圖譜不僅深刻揭示了細(xì)胞間差異的分子根源，還清晰展現(xiàn)了大腦組織發(fā)育過程中的微妙變化，為探索遺傳性疾病的復(fù)雜發(fā)病機(jī)制提供強(qiáng)有力的工具。
麥克奧迪助力時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究
值得一提的是，此次時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)的研究專題成果，離不開高性能顯微鏡這一關(guān)鍵工具的助力——麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡。
麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡，為華大研究院的科研人員提供了洞察微觀世界的窗口。無論是生物樣本的精細(xì)結(jié)構(gòu)解析，還是基因表達(dá)產(chǎn)物的直觀可視化，PA53掃描系列顯微鏡都能以優(yōu)異的光學(xué)性能、精準(zhǔn)的成像技術(shù)和人性化的操作設(shè)計(jì)，助力時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究的深入發(fā)展。
麥克奧迪助力時(shí)空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究
PA53掃描系列是麥克奧迪光學(xué)公司自主研發(fā)設(shè)計(jì)的數(shù)字切片顯微鏡掃描平臺(tái)，它將傳統(tǒng)的玻璃切片進(jìn)行掃描和無縫拼接，生成包括傳統(tǒng)玻璃切片內(nèi)所有信息的全視野的數(shù)字化切片。目前，該系列顯微鏡被廣泛應(yīng)用于生物樣品的觀察和分析、研究生物醫(yī)學(xué)材料與組織的相互作用、基因表達(dá)與檢測(cè)等領(lǐng)域，為科研和醫(yī)學(xué)診斷提供重要的手段和方法。
參考資料：
[1] Mengnan Cheng et al., Spatially resolved transcriptomics: a comprehensive review of their technological advances, applications, and challenges. Journal of Genetics and Genomics(2023).
[2] Ao Chen et al., Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays. Cell (2022).
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