對于大多數(shù)實驗室來說，正確的決定取決于科學和成本的某種結合。需要考慮的一些問題是：
您需要多少材料以及需要多長時間？
早期探索型項目可能只需要有限數(shù)量的材料，或者您的工作流程可能一次僅使用幾微克的抗體。利用多克隆生成對于這些情況非常有效。兔子是多克隆抗體的行業(yè)標準，因為它具有強大的免疫系統(tǒng)，并且可以根據(jù)需要靈活地一次生產(chǎn)多年的抗體。如果您需要預先大量的材料而不是長期使用，那么對較大的動物（例如山羊）進行免疫可能會有所幫助。
然而，如果您正在嘗試生產(chǎn)用于有可能無限期使用的檢測的試劑，那么單克隆生產(chǎn)可能更理想。
抗體的活性是否必須始終相同，或者某些批次間的差異在您的系統(tǒng)中是否可行？
通過多克隆生產(chǎn)，動物得到免疫，您的測試物品就成為最終收集到的一切。隨著時間的推移，反應可能會發(fā)生變化或成熟，但可以通過在檢測中使用一致量的抗體來減輕這種情況。
同時，單克隆生產(chǎn)的明確目的是執(zhí)行多個篩選步驟，以找到表達適合您的檢測反應的抗體的單個細胞系。只要能夠保持穩(wěn)定性，該細胞系就應該能夠在您需要時表達抗體。最終一致性的最終保證是對抗體的可變區(qū)進行測序并將其生產(chǎn)為重組蛋白。
該項目有時間限制嗎？
多克隆項目平均需要三個月的時間，而分離出具有所需性能的特定單克隆細胞系可能需要六個月的時間。此后生產(chǎn)重組蛋白形式的抗體可能還需要三個月或更長時間。
您是否已經(jīng)擁有希望與新生成的材料并行使用的現(xiàn)有抗體？
無論您當前擁有的抗體是多克隆還是單克隆，請選擇不同的物種來開發(fā)第二抗體。這樣您就可以用單獨的二抗進行探測并同時查看兩種反應性。例如，在雞、山羊或豚鼠中制備多克隆是最常選擇與現(xiàn)有兔抗體并行使用的選項。
您的預算是多少？
由于固有的成本效益（平均單克隆成本約為平均多克隆成本的六倍），同時多種抗體的高通量需求很可能會利用多克隆生產(chǎn)。然而，對于早期診斷或治療，以單克隆項目開始可能會更好地滿足您的整體需求，并在項目加速方面帶來紅利。
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