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高分辨率熔解曲線(HRM)分析預混Mix(PCR),*敏感性!

時間:2019/3/5閱讀:1891
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高分辨率熔解曲線(high-resolution melting,HRM)是一種基于單核苷酸熔解溫度不同而形成不同形態(tài)熔解曲線的基因分析新技術,具有*的敏感性,可以檢測出單個堿基的差異。

作為一種穩(wěn)健的"post-PCR"技術,它不受突變堿基位置與類型的限制,無需序列特異性探針,在PCR結束后直接運行高分辨熔解即可完成對樣品的分析。HRM技術因操作簡便快捷、成本低廉、結果準確,并且實現了真正的閉管操作而受到普遍關注。

 

HRM原理: 

在PCR反應前將新型DNA飽和熒光染料加入反應體系,然后將PCR產物直接導入高分辨熔解分析儀中,在一定的溫度范圍內將PCR擴增產物進行加熱變性,儀器的光學檢測系統(tǒng)采集、分析熒光信號并繪制溫度熔解曲線,根據不同熔解曲線形狀來區(qū)分(單個)堿基差異。 

廣泛的 HRM 分析應用領域是基因篩查?;蚝Y查是搜索 PCR 擴增片段中是否存在未知變異,它可在測序步驟之前進行或者作為替代測序方法。由于 PCR 產物突變可導致 DNA 熔解曲線的形狀改變,因此它可以利用 HRM分析檢測。雜交雙鏈 DNA 樣本擴增并熔解時,其熔解曲線不同于純合野生型或突變樣本。如果操作得當,可以減少至少95%的測序工作量。隨著DNA染料和分析儀器的發(fā)展,HRM技術還將繼續(xù)完善和改進,在遺傳病分子診斷領域發(fā)揮更多的作用。 

HRM應用: 

• 基因篩查 (突變研究)

• 雜合性研究

• 突變分析

• 物種鑒定

• 單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 檢測

• 甲基化分析

 

作為專注于PCR領域超過24年的高品質試劑供應商,Solis BioDyne為您推薦,5X熱啟動EvaGreen高分辨率熔解曲線分析-預混Mix(PCR): 

名稱

貨號

兼容的PCR儀器

5x HOT FIREPol EvaGreen HRM Mix (NO ROX)

08-31-00001

Bio-Rad: CFX96™ & CFX384™
Qiagen: Rotor-Gene® 6000
Eppendorf: Mastercycler®: ep realplex2 & ep realplex4
Illumina: The Eco™
Roche: LightCycler® 480

* 不含參比染料ROX,如需要含ROX,請選擇:08-33-00001

5X熱啟動EvaGreen高分辨率熔解曲線分析-預混Mix(PCR)提供如下組分:

  • HOT FIREPol®DNA Polymerase
  • 5x EvaGreen®HRM buffer
  • 12.5 mM MgCl2 = 1x PCR solution – 2.5 mM MgCl2
  • dNTPs
  • EvaGreen®dye
  • BSA

(客戶僅需準備水,模板DNA,引物即可)

 

*的性價比(進口品質,國產價格): 

Solis BioDyne

08-31-00001

1ml(250次)

386

1.54

Thermo

4415452

5*5ml(2500次)

18856

7.54

Qiagen

206546

25ml(2000次)

21810

10.9

DBI

DBI-2232

1000次

11000

11

天根(Tiangen)

FP210-02

500次

2480

4.96

宇恒生物(UE)

S2013

500次

2300

4.6

推薦的qPCR反應體系配置: 

5x HOT FIREPol® EvaGreen® HRM Mix

4 µl

1x

正向引物 (10 pmol/µl)

0.16-0.5 µl

80-250 nM

反向引物 (10 pmol/µl)

0.16-0.5 µl

80-250 nM

DNA模板

可變

可變

H2O(PCR級)

up to 20 µl

 

Total

20 µl

 

* DNA模板濃度:cDNA 0.1 pg/μl -10 ng/μl ; gDNA 10 pg/μl – 4 ng/μl

推薦的qPCR反應程序: 

起始激活(熱啟動)

95ºC

12 min

1

變性

 95ºC

15 s

40

退火

60º-65ºC

20 s

延伸

72ºC

20 s

 

發(fā)表文章實驗結果展示:

【1】Negrisolo, Susanna et al. “Could the interaction between LMX1B and PAX2 influence the severity of renal symptoms?” European Journal of Human Genetics 26 (2018): 1708-1712.

使用Solis試劑盒,分析PAX2基因4號外顯子的錯義突變

【2】Gaczkowska, Agnieszka, et al. “Association of CDKAL1 Nucleotide Variants with the Risk of Non-Syndromic Cleft Lip with or without Cleft Palate.” Journal of Human Genetics, vol. 63, no. 4, 2018, pp. 397–406.

使用Solis試劑盒,分析CDKAL1基因SNP

HRM分析成功的關鍵: 

1.保持較短的擴增片段,實現高的靈敏度。與較大的擴增片段相比,100 bp 左右的擴增片段可簡化單核苷酸熔解曲線的檢測。

2.確保 PCR 擴增片段的特異性。錯配產物和引物二聚體可使數據解釋復雜化。引物濃度低于 200nM,MgCl2 在 1.5 mM至3 mM 范圍及使用熱啟動DNA 聚合酶將有助于獲得高特異性。

3.確保反應使用足夠的模板。一般而言,Ct 應低于30,以生成足夠的材料,實現準確的熔解分析。 

除了上述的穩(wěn)健的HRM分析預混Mix產品,Solis BioDyne為客戶提供終點PCR(end-point PCR),qPCR(real-time PCR),反轉錄PCR(Reverse transcription),以及其它PCR所需的配套試劑。產品線縱覽圖如下:

 

Solis BioDyne來源于歐盟-愛沙尼亞共和國,專注PCR領域超過24年,Solis BioDyne一直致力于開發(fā)和生產高品質的生命科學試劑,現已成為當今歐洲領xian的試劑供應商之一。高標準的生產標準和服務使Solis BioDyne成為值得信賴的首xuanPCR供應商。我們的DNA聚合酶,PCR Master Mixes,qPCR Mixes和其它試劑被110多個國家的研究者所使用,包括頂ji研究機構和生物技術公司。 

Solis BioDyne擁有獨jia的蛋白質穩(wěn)定技術專li,確保其PCR酶與PCR Mixes產品具有*的穩(wěn)定性,研究者可以常溫運輸以及常溫下配置PCR反應體系(無需冰盒)。即使是室溫放置30天,其酶活性也沒有損耗。 

作為Solis BioDyne在中國的區(qū)域總代理,艾美捷科技有限公司將為中國客戶提供全面的Solis BioDyne產品以及訂制服務。

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