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在抗生素與細菌長達 70 余年的對抗中,日益嚴峻的抗菌素耐藥性問題正推動科研走向縱深。最新研究發(fā)現(xiàn),細菌釋放的揮發(fā)性有機化合物(VOCs)——這些由代謝活動生成的“分子指紋",為精準識別菌種、破解耐藥機制提供了關鍵線索!Longshorewell Institute 研究團隊通過vAPCI-CMS 質(zhì)譜聯(lián)用方案,成功捕獲細菌代謝釋放的揮發(fā)性有機物(VOCs),僅需 24 小時即可 100% 區(qū)分大腸桿菌與金黃色葡萄球菌,2 小時即顯示部分區(qū)分能力!
技術亮點
快速檢測:僅需2分鐘完成樣本分析
高靈敏度:區(qū)分大腸桿菌(E.coli)與金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)
實時監(jiān)測:非破壞性采樣,支持長時間動態(tài)監(jiān)測,追蹤細菌生長過程中的VOC變化
實驗成果
24小時內(nèi)實現(xiàn)100%靈敏度與特異性區(qū)分;
僅需2小時即可部分區(qū)分細菌種類;
通過代謝組學分析,揭示細菌生長與VOC釋放的動態(tài)關系。
實驗方法
細菌平板制備流程
采用OD600值在0.2-0.5 AU(吸光度單位)的液體培養(yǎng)基菌液,制備細菌平板(見圖1)。所有接種平板均以一式三份制備,接種后置于37°C恒溫箱培養(yǎng),確保數(shù)據(jù)可重復性。同步制備三組空白瓊脂平板,與接種平板共同培養(yǎng),精準排除培養(yǎng)基背景干擾。
圖 1:(A) 大腸桿菌培養(yǎng)的瓊脂平板;(B) 金黃色葡萄球菌培養(yǎng)的瓊脂平板;以及兩者同時生長的平板。
vAPCI-MS細菌VOCs分析全流程
儀器配置:
采用 AIS expression CMS 質(zhì)譜儀,搭載 vAPCI 離子源(圖2)
圖 2:vAPCI-CMS,用于采集揮發(fā)性有機化合物。
定制化平板采樣器(圖3)恒溫 37°C,與 100°C 加熱傳輸線直連。
圖 3:為 90mm 瓊脂平板設計的定制 VOC 采樣器,直接連接到 vAPCI
核心參數(shù):
離子源氣體溫度:350°C;
毛細管溫度:250°C;
傳輸線溫度:100°C;
動態(tài)采樣傳輸線流速:600 mL/min;
質(zhì)荷比范圍:m/z 30-300;
單次掃描時間:400毫秒;
接種后2/6/24/48/72/96小時取樣,單次分析僅需2分鐘對大腸桿菌進行24小時不間斷采樣,動態(tài)捕捉VOCs代謝指紋演變。
實驗結果
細菌VOCs的檢測
每個樣本通過 150 次質(zhì)譜掃描疊加,生成高信噪比特征光譜。圖 4 顯示了空白瓊脂板和接種 24 小時的大腸桿菌平板,差異峰直觀呈現(xiàn)菌株特異性代謝指紋。
圖 4:空白瓊脂平板(左)和接種 24 小時后的大腸桿菌平板的光譜
細菌VOC特征的區(qū)分
使用 SIMCA 軟件包(Umetrics,版本 14.1)進行多變量分析。利用從 m/z 30 到 300 的每個 m/z 響應生成統(tǒng)計模型,分別使用偏最小二乘判別分析(PLS-DA)和主成分分析(PCA)。對空白、大腸桿菌和金黃色葡萄球菌在 2 至 96 小時的每個時間點的聚類進行了評估。24 小時后空白組/大腸桿菌/金葡菌實現(xiàn) 100% 敏感度&特異性分離。在 2 小時時觀察到部分分離,金黃色葡萄球菌的靈敏度為 100%,特異性為 91.3%,而大腸桿菌的靈敏度為 87.5%,特異性為 73.9%(圖 5),提示代謝指紋在菌種潛伏期已具差異性!
圖 5:接種后 2 小時(左)和 48 小時(右)的空白瓊脂、大腸桿菌和金黃色葡萄球菌的 PCA 分析得分圖
細菌生長動態(tài)追蹤
大腸桿菌是一種產(chǎn)生吲哚(m/z 118)的細菌,這是大腸桿菌光譜中的主要離子。通過在 24 小時內(nèi)監(jiān)測 m/z 118 的變化,可以確定大腸桿菌的生長曲線(圖 6)
圖 6:連續(xù) 24 小時監(jiān)測吲哚(m/z 118)的大腸桿菌生長曲線
多菌株同步檢測
基于多變量分析(MVA)篩選的特征標記物,可以實現(xiàn)大腸桿菌(E.coli)與金黃色葡萄球菌(S.aureus)的同步精準鑒別。圖7展示混合菌株的特征質(zhì)譜峰疊加圖譜。
圖 7:金黃色葡萄球菌(A)和單一平板上同時存在金黃色葡萄球菌和大腸桿菌(B)的譜圖
總結
基于 vAPCI 離子源與 AIS expression 質(zhì)譜儀的聯(lián)用技術,體外細菌培養(yǎng)物揮發(fā)性有機物(VOCs)檢測方案已通過實驗驗證。該技術具備以下核心優(yōu)勢:
非破壞性采樣
支持對細菌代謝特征的長期動態(tài)監(jiān)測,避免樣本損耗,適用于連續(xù)培養(yǎng)研究
智能菌株鑒別
24小時實現(xiàn)菌株100%精準區(qū)分(靈敏度與特異性雙達標);
2小時早期預警:部分菌株(如金黃色葡萄球菌)鑒別準確率超91%
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