購買新柱后一定要仔細閱讀說明書，查看柱的保持溶劑、使用PH值范圍、最大耐壓。 每根色譜柱上都有一個流動方向箭頭，不要隨意改變流動方向，這樣會降低柱效。 使用時記錄使用壓力。
色譜活化
注意：
a.柱子中的保存液體與使用流動相之間要互溶，如果不溶請使用中介流動相（異丙醇或1，4-二噁烷等），由于中介流動相黏度大，請使用低流速；
b.使用廠家推薦的活化程序；
c.正相柱子使用反相模式，一定要注意保存溶劑和使用流動相之間的互溶。
保護柱
注意：
a.與分析柱連接時，連接管路盡可能短，且接口切面平滑，盡量減少死體積以降低柱外展寬效應。
b. 卡套式保護柱一般未標注液流方向，使用時最好自行標注，并按照標注方向來使用，以免反向使用后，截留的雜質(zhì)污染分析柱。
c. 直接填裝的短柱型保護柱，出現(xiàn)柱壓升高或峰型變差時，可不接分析柱進行反向清洗，清洗溶劑可參考分析柱清洗溶劑。
d. 卡套式保護柱，柱芯替換時，注意柱芯與柱套是否存在方向上的匹配，同時不易旋擰過緊，以防滑絲。
e. 保護柱或柱芯一般不建議超聲清洗，因可能對填料表面修飾有影響。
f. 如同一保護柱配不同的分析柱使用，每次使用前，保護柱需先清洗并用流動相平衡保護柱一段時間后，再接分析柱使用。
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