蛋白質(zhì)的種類繁多，結(jié)構(gòu)復(fù)雜，迄今為止沒有一個(gè)理想的分類方法。著眼的測(cè)面不同，分類也就各異，例如從蛋白質(zhì)形狀上，可將它們分為球狀蛋白質(zhì)及纖維狀蛋白質(zhì)；從組成上可分為單純蛋白質(zhì)（分子中只含氨基酸殘基）及結(jié)合蛋白質(zhì)（分子中除氨基酸外還有非氨基酸物質(zhì)，后者稱輔基）；單純蛋白質(zhì)又可根據(jù)理化性質(zhì)及來源分為清蛋白（又名白蛋白，albumin）、球蛋白（globulin）、谷蛋白（gluin）、醇溶谷蛋白（prolamine）、精蛋白（protamine）、組蛋白（histone）、硬蛋白（scleroprotein）等（見表1?）。結(jié)合蛋白又可按其輔基的不同分為核蛋白（nucleoprotein）、磷蛋白（phosphoprotein）、金屬蛋白（metalloprotein）、色蛋白（chromoprotein）等（見表1-5）。

　　此外，還可以按蛋白質(zhì)的功能將其分為活性蛋白質(zhì)（如酶、激素蛋白質(zhì)、運(yùn)輸和貯存蛋白質(zhì)、運(yùn)動(dòng)蛋白質(zhì)、受體蛋白質(zhì)、膜蛋白質(zhì)等）和非活性蛋白質(zhì)（如膠原、角蛋白等）兩大類。